Amigo tambem tive problemas com o Far Cry 3, o meu era diferente, tinha hora no meio do jogo que ele desligava o monitor e depois o ligava novamente, ai o jogo voltava com um desempenho horrível, só que meu problema era a temperatura que em certos momentos do jogo ficava muito alto devido a baixa velocidade do Fan que ficava só entre 30 e 40%, aumentei a velocidade do Fan e problema resolvido. Tente reinstalar o jogo, caso não funcione tente reinstalar os drivers da placa, se da mesma forma não funcionar desinstale o jogo os drivers, faça uma faxina no seu windows, ai creio de de ultimo caso se nada resolver tente formatar o pc, e principalmente verifique a temperatura do pc enquanto ele inicia o jogo.